10-09-2012
|
#1
|
Prof. Dr. Sinsi
|
Transfer Enzimlerin Rolü
Başlama olayının dördüncü kademesinden sonra , başlama kodonu izleyen ikinci baz tripleti kendi aminoaçil-tRNA’sını kabule hazırdır İç aminoasitlerin montesi için , her zaman , bazı faktörlere gereksinim vardır Bunlar, ultra santrifüjle fraksiyonu yapılan hücre ekstraktının , süpernatant 100 000 * g , kısa adıyla s-100 denen maddelerinin içerisinde çözülmüş olarak bulunur Ribozomlarla bağlanan (yığışım yapan) f, bağlama ve başlama faktörlerinin aksine, daha sonra diğer bir hücre kompartimentinden elde edilir
Protein sentezinin beşinci kademesinde , ikinci aminoasit, tam (komple) oluşmuş ribozomun girişine bağlıdır Bu adım, bir T( transferden gelme) faktörünün ve parçalanmamış GTP’nin bulunduğu ortamda gerçekleşir T faktörünün özellikleri , büyük ölçüde , f1 faktörünün özelliklerine benzer Bu faktör , f1’in aksine, başlama kodonunu değil, diğer kodonları tanır Adı geçen T faktörü bir termosta bil ( Ts) = ısıya dayanıklı ) ve birde termosta bil olmayan (Tu) = ısıya dayanıksız) iki kısma ayrılır Ts , Tu ile GTP’nin yığışımını katalizler ve daha sonra aminoacil-tRNA ile stabil (dayanıklı)bir yapışma , tutunma kompleksi oluşur
GTP + Tu Ts GTP/Tu
Aminoaçil-tRNA
GTP/Tu GTP/Tu /aminoaçil-tRNA
Tutunma kompleksi , ribozomun giriş tarafı üzerindeki ikinci kodon ile bağlanır T faktörünün , ayrıca , kodon ile3 anti kodonunun karşılıklı etkileşiminde , sabitleştirici bir özelliğe sahip olup olmadığı bilinmemektedir
Daha sonra , altıncı kademede , girişte bulunan aminoacil –tRNA , çıkış bölgesine doğru kayar Bu translokasyon(yer değiştirme9 , ribozomun üçüncü yapısının tekrar değişmesi ve bağlı GTP’deki bir fosfatın kullanılması ile gerçekleşir Parçalanma ribozoma özelleşmiş bir GTPaz’ın ortaya çıkmasını sağlar Bu GTPaz , faktör G , yani “Translokaz” (bazı hallerde yanlış olarak peptit sentetaz şeklinde kullanılır) olarak tanımlanmıştır
Hem T faktörü , hem G faktörü , hayvanlardaki protein sentez sistemleri içinde bulunan aminoaçil transferazlara büyük ölçüde uygunluk gösterir; fakat aynı değildir Transferaz-I , bakteriyel T-faktörü gibi, transferaz-II ise G faktörü gibi davranır Transferaz-I , keza “Bağlama enzimi” olarak da tanınır
Sentetazların ve bağlayıcı faktörlerin canlı gruplarına göre gösterdikleri özgüllük gibi transferaz faktörler de keza ancak homolog (kököndeş) ribozomlarla tepkimeye girer T ve faktörleri ancak bakteriyel ribozomlarla (hayvanlarınkiyle , özellikle memeli hayvanlarınkiyle değil) transferaz-I ve II ise ancak hayvansal ribozom larla (bakteriyel ribozomlarla değil) bağ yapabilir E coli ribozomlarında hem G hem T görevini yüklenmiş bir polimerizasyon faktörü tanımlanmıştır ; bu faktörün aktivitesi , G ve T faktörlerinde olduğu gibi birbirinden ayrılmış durumda değildir
İkinci aminoasidin tRNA’sını mRNA’ya bağlanmasından sonra , bunu ribozom üzerinde 1 ve 2 aminoasitlerin birbirine bağlanması “peptit bağı” izler Bu bağlanma kendiliğinden meydana gelen bir olay değildir tRNA’ya bağlı aminoasitteki enerji , peptit bağı için yeterlidir Çünkü peptit bağlarının gerek duyduğu serbest enerji , aminoacil-tRNA bağında bulunan enerjiden çok daha azdır Bu peptit bağının oluşumu , ribozomlarda protein olarak bulunan 50 S alt birimi üzerine gömülmüş “peptidiltransferaz “ denen bir enzim tarafından katalizlenir Peptit bağı , bir aminoasidin amino grubunun başka bir aminoasidin karboksil grubuna bağlanmasıdır
|
|
|