Bilgisayarda Canlı Organizma Yaptılar!

**Prof. Dr. Sinsi** · 10-07-2012

Amerikalı bilim adamları, yaşam döngüsünün incelenmesine olanak tanımak için ilk kez bir organizmanın bilgisayar modelini yaptı

"Cell" dergisinde yayımlanan araştırmada, Stanford Üniversitesi Biyoteknik Bölümü'nden Doç

Dr

Markus Covert başkanlığındaki bilim adamları, başka organizmalara bağımlı olmadan yaşayan dünyanın en küçük bakterisi Mikoplazma genitalyum'un DNA'sının ve bakterinin tek bir hücresindeki bileşenlerin simülasyonunu yaptı

Araştırmacılar, bakterinin yaşam döngüsünde yer alan her bir moleküler etkileşim için 900'den fazla bilimsel çalışmayı inceledi

Hücrenin geniş kapsamlı bilgisayar modeli, hem hücrelerin işlevlerinin anlaşılmasına yardımcı olacak hem de hastalıkların teşhis ve tedavisine önemli katkıda bulunacak

Doç

Dr

Covert, kanser, Alzheimer gibi hastalıkların tek bir genle ilgili olmadığını, yüz binlerce genin birbiriyle etkileşim halinde olmasının karmaşık bir sonucu olarak tanımlanmaları gerektiğini belirtti

Covert, bilgisayar modelinin genler arasındaki etkileşimin anlaşılmasına yardımcı olacağına işaret etti

İnsanların idrar yolları ve cinsel organlarının yanı sıra solunum sisteminde görülen Mikoplazma genitalyum, organizmalar arasında en küçük genoma sahip

Mikoplazma genitalyum, 4288 gene sahip E

coli bakterisinin tersine sadece 525 gen taşıyor

Bilim adamları, cinsel yollarla bulaşan bakteriyi küçük genomu için tercih etti

Bakterinin bilgisayar modelini yapmak için 1900'den fazla parametreden yararlanan araştırmacılar, biyolojik süreçleri her biri kendi algoritması tarafından yönetilen 28 farklı modül olarak tasarladı

Daha sonra bu modüller, birbirleriyle etkileşime geçirilerek bir bütün olarak çalışmaları sağlandı

Araştırmada DNA'ları birleştiren protein dinamikleri ve yeni gen işlevleri de ayrıntılı olarak tanımlandı

Simulasyon, araştırmacılara çok sayıda etkileşim faktöründen kaynaklanan hücre davranışını gözlemleme fırsatı da tanıdı

Araştırmacılar, model sayesinde hücre döngüsündeki her bir evrenin hücreden hücreye farklılık gösterdiğini ortaya çıkardı

10-07-2012	#1
Prof. Dr. Sinsi	Bilgisayarda Canlı Organizma Yaptılar! Amerikalı bilim adamları, yaşam döngüsünün incelenmesine olanak tanımak için ilk kez bir organizmanın bilgisayar modelini yaptı "Cell" dergisinde yayımlanan araştırmada, Stanford Üniversitesi Biyoteknik Bölümü'nden Doç Dr Markus Covert başkanlığındaki bilim adamları, başka organizmalara bağımlı olmadan yaşayan dünyanın en küçük bakterisi Mikoplazma genitalyum'un DNA'sının ve bakterinin tek bir hücresindeki bileşenlerin simülasyonunu yaptı Araştırmacılar, bakterinin yaşam döngüsünde yer alan her bir moleküler etkileşim için 900'den fazla bilimsel çalışmayı inceledi Hücrenin geniş kapsamlı bilgisayar modeli, hem hücrelerin işlevlerinin anlaşılmasına yardımcı olacak hem de hastalıkların teşhis ve tedavisine önemli katkıda bulunacak Doç Dr Covert, kanser, Alzheimer gibi hastalıkların tek bir genle ilgili olmadığını, yüz binlerce genin birbiriyle etkileşim halinde olmasının karmaşık bir sonucu olarak tanımlanmaları gerektiğini belirtti Covert, bilgisayar modelinin genler arasındaki etkileşimin anlaşılmasına yardımcı olacağına işaret etti İnsanların idrar yolları ve cinsel organlarının yanı sıra solunum sisteminde görülen Mikoplazma genitalyum, organizmalar arasında en küçük genoma sahip Mikoplazma genitalyum, 4288 gene sahip E coli bakterisinin tersine sadece 525 gen taşıyor Bilim adamları, cinsel yollarla bulaşan bakteriyi küçük genomu için tercih etti Bakterinin bilgisayar modelini yapmak için 1900'den fazla parametreden yararlanan araştırmacılar, biyolojik süreçleri her biri kendi algoritması tarafından yönetilen 28 farklı modül olarak tasarladı Daha sonra bu modüller, birbirleriyle etkileşime geçirilerek bir bütün olarak çalışmaları sağlandı Araştırmada DNA'ları birleştiren protein dinamikleri ve yeni gen işlevleri de ayrıntılı olarak tanımlandı Simulasyon, araştırmacılara çok sayıda etkileşim faktöründen kaynaklanan hücre davranışını gözlemleme fırsatı da tanıdı Araştırmacılar, model sayesinde hücre döngüsündeki her bir evrenin hücreden hücreye farklılık gösterdiğini ortaya çıkardı